Значение фамилии - Шалыганов Шалыгин. Отчества от прозвищ из нарицательных шалыган, шалыга. Диалекты сохранили слово шалыган - "бездельник, шатун" (Сл. Мельниченко, Сл. рус. гов. НО), но в Забайкалье известен отыменный глагол шалыганить - "шутить, смеяться" (Сл. Элиасова).